פרויקט "נפתולי מורד וגאון הירדן" מהווה שלב חדש בפרויקט השיקום הלאומי רחב–ההיקף המתבצע במקטע הדרומי בשנים האחרונות
הפרויקט מתבצע כחלק משותפות ארוכת–שנים עם רשות הטבע והגנים, המועצות האזוריות עמק הירדן ועמק המעיינות, הקרן לשמירה על שטחים פתוחים, המשרד להגנת הסביבה ומשרד החקלאות.
מטרת הפרויקט היא לתקן את הפגיעה המשמעותית באפיק הנחל ומימיו שהתחוללה במאה השנים האחרונות, החל מעבודות תיעול הנחל להובלת מים מהכנרת עבור מפעל החשמל בנהריים, שתוכנן ובוצע על ידי פנחס רוטנברג ומשנות השישים של המאה שעברה, פגיעה בנחל באמצעות הובלת המים המליחים של המוביל המלוח ומי חמי טבריה באפיק ופגיעה נוספת וקשה של הזרמת הביוב של טבריה ויישובי עמק הירדן אל מי הנהר.
מנכ"ל רשות ניקוז ונחלים כנרת, המבצעת את פרויקט שיקום מורד הירדן, צביקה סלוצקי: "אני מברך את ממשלת ישראל על אישור המשך התקצוב של הפרויקט לשיקום חלקו הדרומי של נהר הירדן, 'נפתולי מורד וגאון הירדן', בין הכנרת ואתר נהריים, המתבצע בעלות של 70 מיליון שקלים. ישנה חשיבות לאומית לקיומו של פרויקט זה, להצלתו ושיקומו של הנהר וכלל המסדרון האקולוגי המקשר בין הכנרת לירדן. זהו שיקום קריטי לנהר החשוב בישראל.
"הפעולות המבוצעות בשנים האחרונות כחלק מהפרויקט הנן שיפור מורפולוגי של האפיק והשבתו להיות נחל הכולל מגוון בתי הגידול, ניקוי הבוצה מקרקעית הנחל, שתילת צמחייה אופיינית מקומית וכן פיתוח מרכיבי טיילות ונופש לאורך הנחל".
